O problema da subsequência comum máxima sem repetições

Exploramos o seguinte problema: dadas duas sequências X e Y sobre um alfabeto finito, encontre uma subsequência comum máxima de X e Y sem símbolos repetidos. Estudamos a estrutura deste problema, particularmente do ponto de vista de grafos e de combinatória poliédrica. Desenvolvemos algoritmos de ap...

Full description

Bibliographic Details
Author: Tjandraatmadja, Christian
Format: master thesis
Status:Published version
Publication Date:2010
Country:Brasil
Institution:Universidade de São Paulo (USP)
Repository:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Language:Portuguese
OAI Identifier:oai:teses.usp.br:tde-13092010-093911
Online Access:http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-13092010-093911/
Access Level:Open access
Keyword:algoritmos de aproximação
approximation algorithms
branch-and-cut
combinatória poliédrica
heurísticas
heuristics
integer programming
longest common subsequence
polyhedral combinatorics
programação inteira
repetition-free longest common subsequence
subsequência comum máxima
subsequência comum máxima sem repetições
Description
Summary:Exploramos o seguinte problema: dadas duas sequências X e Y sobre um alfabeto finito, encontre uma subsequência comum máxima de X e Y sem símbolos repetidos. Estudamos a estrutura deste problema, particularmente do ponto de vista de grafos e de combinatória poliédrica. Desenvolvemos algoritmos de aproximação e heurísticas para este problema. O enfoque deste trabalho está na construção de um algoritmo baseado na técnica branch-and-cut, aproveitando-nos de um algoritmo de separação eficiente e de heurísticas e técnicas para encontrarmos uma solução ótima mais cedo. Também estudamos um problema mais fácil no qual este problema é baseado: dadas duas sequências X e Y sobre um alfabeto finito, encontre uma subsequência comum máxima de X e Y. Exploramos este problema do ponto de vista de combinatória poliédrica e descrevemos vários algoritmos conhecidos para resolvê-lo.